在第二次\!新!$吉+(
恩 战争、$别]名“夏亚的叛乱”终结后，地球.圈取得了短暂的和平。　　这之:后3年，宇宙世纪 #009+`)6年。在工业殖民地“工业,7号”上进行$了一\项秘密交涉。内)!(容为－－被认为是地球联邦政府#+%暗中.@操控的“比斯特财团”将把最高机密“拉普拉斯之箱”交给新吉恩的残党军“袖付`”。　:#　另+一方面$@，在安纳海姆工业专门学校就读(].的)%少年巴纳吉·
林克斯遇见了自称为(奥 ,黛丽·本的少女（实为旧吉恩公国次#.男多兹鲁·扎比之女，美耐巴·扎比）奥黛丽为`-了制止新的战争$+爆发，必须组%织“拉普拉斯之箱”的交易。巴纳吉(在数*次帮助奥黛丽之=后， @逐渐被她所吸引。　　随后，地球联-邦察觉了 -这起交易，并进行军事介入，工业殖民地随即化为一片=火海。巴纳吉`#(_和同伴一边_避难一边寻找着_(奥黛丽，而出+现在他_%面前的是比斯特财团的当家卡_#+;迪阿 -斯 !_@·比^斯特。奄奄一息的卡:迪阿斯将出:
)生的秘密告诉了巴纳吉，并且将-$箱之钥匙－－“机动战士高达独角兽”托付给他]。]-;　　随/后，*一场围绕“拉普拉斯之箱”的战争开始了……