故事发生在一所名叫第3新东京 世立NERV学园中`
，校长$是严肃又寡言=$的+,^碇原度（[立木文彦 配音）。作为校长的儿_@子，碇真嗣（绪方#)惠美 !配[[\音）  感到压力很大。,于此同时，\ .来!自外国的红 ,发转学生明日:-=香（宫村`优子? 配音），分裂成三个、)#以姐妹)的形式出场的凌波丽（林原惠美 配音）/(都给碇真嗣的学校/生活带来了翻天覆地的变化(。此外，@在原作_$,/`中高大帅气的初号%^@%_机，也将以娇小可爱#的形象，作!为学院的 一份子出现在动画中。　　动画以《新世界福音战士》中的角%#%色为^(原型，一改原作沉重严肃的( %*气氛，描述了轻松愉快的 校$,园生活
$+。制作方首次采用++了3D的Q版 造型，配以实景背景和2D拼接-，造就了多元化的绘画风格。