这是一?段攻壳机动队成立前\`;夕鲜为人知而又影响深[ 远的故事$。2027年6*月6?!日的,一天，隶 ]属陆军机密!?部队501机关的真室中佐（宫 内敦士_ 配音）在闹市街头被人杀害，此前他曾陷入军火买卖`*的贿赂::丑闻不得脱 身，他对死亡背后自然隐藏着无数谜团。阴雨之夜^/，试_图取回真室电= +%子脑的公安9课课长荒卷大辅-（ [塾,一久 配音）与生$化人草薙素子（坂本真绫 配]?音）在真室中佐的墓地:`首 次相遇。此时草薙还只是501$机关负责网#络犯罪追查的军人，/!此行@.-她希望 !找到倍为尊重的中佐蒙冤以及?#遇 害背.后的真相。谁%知，棺木中的中佐早已$?+ =不见了踪影。在此之后，她受=;到荒卷委托展`#开调查,`，并在一连串凶险#追* 查的过程中与前特种部队成员巴特（松田健一郎 配音）和时,为新滨县刑警的陀古萨（新垣樽助 配! 音）邂逅。扑_=+朔迷离+ ,的案情，草薙一^$*,行被引向未知的彼方……　　本片根据士郎正宗的原作改编。