在邪神加坦杰厄和迪迦奥特!$曼的:@-决战结束后，人类世界迎来了长达两年的和平岁月。这一日，入间队长随同GUTS考古队来到位于南太平洋的远古遗迹露^露耶，他们再:(次发现了业已毁灭的超古代城市以及三尊^[.[邪神的石像希特拉（婆裟羅天明 饰）、达拉姆（松田優 _饰）及@:+女?+领袖卡美拉（芳本美代子 饰）。入间极力反`.!对对古迹的:]#触动.\，但丝毫无!=$法改变上_@层的决定!，最终导致?+三尊邪神,%@ 复活?::_，人类再度面临危机。与此同时，圆·大^古（@/长,野博 饰）^与柳濑%·蕾娜（吉本多#?: 香,,美 饰）相%
知相守，即将步=,入婚礼的殿堂。可是邪神指挥其爪#牙/#%向人类世界发起进攻，早已丧失奥\,/特曼力量的] /:大古，!面对当前的危:_(机束手无策。　　三千万年%前毁灭人类文+ 明的遥远,^/,记忆，折磨+*着重新 @大古与迪迦奥特曼的神经……